नमूना निष्कर्षण और तैयारी की गुणवत्ता एमएस परिणामों को महत्वपूर्ण रूप से प्रभावित करती है। जेल बैंड के लिए, कृपया निम्नलिखित निर्देशों का सावधानीपूर्वक पालन करें:
महत्वपूर्ण: हर चरण में संदूषण से बचने के लिए विशेष सावधानी बरतनी चाहिए, विशेष रूप से त्वचा या बालों से केराटिन के साथ (हमेशा साफ नाइट्राइल दस्ताने पहनें और धूल-मुक्त वातावरण में काम करें)।
महत्वपूर्ण: सिल्वरस्टेनिंग का उपयोग न करें! केवल कूमासी-स्टेन्ड जैल!
महत्वपूर्ण: केवल रुचि के बैंड को ही काटें (केवल दाग वाला क्षेत्र) - किसी भी अतिरिक्त जेल से पृष्ठभूमि शोर होगा। यदि बैंड बहुत ही धुंधला है, तो इस बात की संभावना है कि हमें कोई प्रोटीन पहचान नहीं मिलेगी। इसलिए, हमारा सुझाव है कि आप जेल में प्रोटीन सैंपल की अधिकतम संभव मात्रा लोड करें ताकि हमें कूमासी स्टेन के साथ एक काफी दृश्यमान बैंड मिल सके।
नमूने भेजने से पहले हमें जेल की तस्वीर ईमेल करें। इससे हमें यह समझने में मदद मिलेगी कि बैंड ठीक से स्टेन किया गया है या नहीं। इसका उपयोग सैंपल सांद्रता और इसकी जटिलता को समझने के लिए संदर्भ के रूप में भी किया जा सकता है। चूंकि नैनो-एलसी एक अत्यधिक संवेदनशील उपकरण है, इसलिए इष्टतम परिणामों के लिए नैनो-एलसी कॉलम को अतिरिक्त सैंपल से ओवरलोड नहीं करना बहुत महत्वपूर्ण है।
जेल को केवल साफ कांच की प्लेट पर काटें (ओवरहेड प्रोजेक्टर फ़ॉइल या एल्युमिनियम फ़ॉइल का उपयोग कभी न करें)। कांच की प्लेट को 70% इथेनॉल या मेथनॉल जैसे कार्बनिक विलायकों का उपयोग करके साफ किया जा सकता है।
जेल के धब्बों को सटीक रूप से काटने के लिए एक नए साफ स्केलपेल ब्लेड का उपयोग करें।
हमेशा फ़िल्टर किए गए विआयनीकृत पानी का उपयोग करें।
इलेक्ट्रोफोरेसिस के लिए किसी भी फ्लास्क, ट्यूब या कांच की प्लेट को साबुन (या किसी भी पॉलिमरिक डिटर्जेंट) से न धोएँ। हमेशा, अपने कांच के बर्तनों को गर्म पानी से धोएँ और फिर 70% इथेनॉल या मेथनॉल जैसे कार्बनिक विलायक से धोएँ।
एमएस विश्लेषण के लिए जेल चलाने के लिए आवश्यक सभी बफर और दागों को ताज़ा तैयार करें (पुनः उपयोग न करें)।
जेल क्यूब्स को एक साफ माइक्रोसेंट्रीफ्यूज ट्यूब (1.5 मिली) में रखें और जेल क्यूब्स को ढकने के लिए उसमें पर्याप्त मेथनॉल (50% मेथनॉल) डालें। बफर की बड़ी मात्रा को जोड़ने की आवश्यकता नहीं है, उन्हें नम रखना ही पर्याप्त है।
सुनिश्चित करें कि माइक्रोसेंट्रीफ्यूज ट्यूब का ढक्कन लिफ़ाफ़े में डालने से पहले ठीक से बंद हो।
ढक्कन के चारों ओर पैराफ़िल्म का उपयोग न करें।
आप नमूने कूरियर या साधारण डाक से भेज सकते हैं। नमूनों को बर्फ़ पर भेजने की कोई ज़रूरत नहीं है। नमूने 50% मेथनॉल में स्थिर रहते हैं।